En 1963, le commandant cousteau et son équipe de plongeurs tentent une expérience inédite. Ils prennent place dans un village sous-marin artificiel adossé à un récif de corail, par 11 et 26 mètres de fond, dans la mer Rouge. Les océanautes partent à la conquête des profondeurs et rapportent de magnifiques images d'espèces pleines de mystères et de fascination.