Accompagné d'une nouvelle assistante au caractère bien trempé, Donna Noble, le Docteur repart pour de nouvelles aventures à travers la galaxie afin de sauver la Terre d'une menace orchestrée par un ennemi millénaire. Du naufrage du Titanic, vaisseau de plaisance intergalactique, à la destruction de Pompéi, le Docteur fera également la connaissance d'une jeune femme qui se prétend sa fille, ainsi que de la mystérieuse professeur River Song, qui semble trop bien le connaître.