Harrison a maintenant 2 ans et Dexter se demande ce qu'il va transmettre à son fils, particulièrement angoissé à l'idée qu'il soit affecté comme lu d'un "dark passenger", une pulsion mortelle. Cette saison 6, centrée autour de la spiritualité, pousse Dexter à examiner ce en quoi il croit (pas grand chose) et ce en quoi il pourrait croire (une éventuelle part de lumière en lui). Foi et libre arbitre, carrefours de l'existence, justice et injustices.